ברכה אחרי הנטילה - למה?

יש לכך כמה נימוקים:
ראשית, לפעמים לא ניתן לומר את הברכה לפני הנטילה, משום שהידיים מטונפות ואין ראוי לומר את הברכה בידיים מטונפות (וכדי שלא ליצור בלבול בלב הנוטלים, נקבע המנהג שתמיד מברכים לאחר הנטילה).

שנית, הניגוב הוא חלק מהמצווה, מפני שמאוס הדבר לאכול פת בידיים רטובות, וכל עניינה של הנטילה הוא לטהר ולנקות את הידיים לכבוד הסעודה. לפי זה, כל זמן שמברכים לפני הניגוב, נחשב עדיין שמברכים לפני סיום המצווה.

ע"פ פניני הלכה ברכות
http://www.yeshiva.org.il/midrash/shiur.asp?cat=997