נזקי הסערה הגיעו הבוקר (ה') גם לבית העלמין העתיק בצפת. ההר, שבצלעו עומד מקווה האר"י הקדוש, נסחף על מבנה המקווה, וגרם לנזק במקום.
אך על אף הנזק, וכמנהג המקום, עובדי מקווה האר"י ובית העלמין דווקא מרוצים ממה שקרה. צוות בית העלמין בצפת עמל לנסות ולתקן את התקלות, ועם זאת אומרים כי "בסיעתא דישמיא הסחף הזיז את האדמה בצורה התואמת את תכניות הגינון והפיתוח של המקווה".