עימות חריף נוצר הלילה (ג') בין שר הביטחון ישראל כ"ץ לרמטכ"ל אייל זמיר, בעקבות קיום דיון שיבוצים בראשות הרמטכ"ל למינוי מפקדים לתפקידי ליבה במערך המבצעי ובמטה בדרגת תת-אלוף. בדיון נבחרו מינויים חדשים, והדבר נעשה ללא תיאום עם שר הביטחון, שלפי החוק אמור לאשר את אותם מינויים. הראשון שהוציא הודעה לתקשורת היה שר הביטחון, שתקף את קיום הדיון לאחר שדווח בתקשורת על השיבוצים החדשים. אחריו פרסם צה"ל את רשימת המינויים והצהיר כי "הרמטכ"ל מחליט", ולאחר מכן השיב שר הביטחון כי "הדרג הצבאי כפוף לשר הביטחון".
"הרמטכ"ל הינו הסמכות היחידה בפקודות למינוי מפקדים בדרגת אל"ם ומעלה"
"דיון השיבוצים שקיים הרמטכ"ל נעשה בניגוד להנחיית שר הביטחון וללא תיאום והסכמה מוקדמת, וזאת בניגוד לנוהל המקובל, ולכן אין בכוונת שר הביטחון לדון כלל במינויים ובשמות שפורסמו או לאשר אותם. הרמטכ"ל יידרש לתיאום מוקדם עם שר הביטחון כדי לדון במינויים אלה או אחרים בהמשך" - תקף ראשון שר הביטחון את הרמטכ"ל, שלא נשאר חייב והחזיר באמצעות דובר צה"ל: "הרמטכ"ל הינו הסמכות היחידה בפקודות למינוי מפקדים בדרגת אל"ם ומעלה. הרמטכ"ל מקיים דיון איוש סדור בהשתתפות פורום מטכ"ל. הרמטכ"ל הוא המחליט על המינויים - לאחריו המינוי מגיע לאישור השר, אשר ביכולתו לאשר או לא לאשר את המינוי".
לאחר הודעת הרמטכ"ל זמיר ופרסום השיבוצים החדשים, שר הביטחון כ"ץ פרסם הודעה תוקפנית שנייה נגד הרמטכ"ל זמיר: "מאחר ומדובר במינויים משותפים לשר הביטחון ולרמטכ"ל, יש נוהל מקובל שבו הרמטכ"ל נפגש עם שר הביטחון ומציג בפניו מספר מועמדים אפשריים לכל תפקיד. לא מתקיים דיון שיבוצים לפני ביצוע התהליך הנ"ל. גם במקרה זה השר הבהיר לרמטכ"ל כי הוא צריך פרק זמן נוסף, ואין לקיים את הליך הדיון בשיבוצים בשלב זה. הדרג הצבאי כפוף לשר הביטחון ויפעל בהתאם להנחיותיו ולמדיניות שייקבע".