החקירה סביב ניסיון הפיגוע בטיסת פליי דובאי נמשכת, ובמערכת הביטחון עדיין מתקשים לקבוע אם הטייס המשנה העומאני, המאם אל-המאמי, פעל במסגרת רחבה יותר או לבדו. המוסד מקיים קשר ישיר עם מקביליו באיחוד האמירויות ובסעודיה, אולם לדברי גורם ביטחוני, גם המידע שהתקבל עד כה אינו מאפשר לקבוע באופן חד משמעי אם הטייס מסתיר מידע רגיש או אם יש קשר בין מעשיו לבין איראן.
"אנחנו בערפל"
"אנחנו בשלב זה בערפל", סיפר אחד הגורמים המעורים בנושא לאתר "וואלה". "אין מידע שיכול לשלול או לאמת קשר או מעורבות של איראן בטייס המשנה. בשלב זה ההערכה במערכת הביטחון היא שהוא פעל לבדו". במקביל, המוסד, השב"כ ואמ"ן מרכזים מאמצי איסוף במטרה להשלים את התמונה סביב הטייס ולבדוק גם אם קיימים טייסים נוספים בעלי פרופיל דומה.
לצד בירור המניעים והקשרים האפשריים, במערכת הביטחון בוחנים גם את הכשלים שאפשרו לטייס בעל אזרחות עומאנית, שעבר תהליך רדיקליזציה והחליף כמה מקומות עבודה בפרקי זמן קצרים, להגיע לישראל במטוס מאיחוד האמירויות. הטיסה כללה נוסעים ישראלים, והחשש הוא כי מטרתו הייתה לרסק את המטוס ולפגוע באזרחים נוספים שעל הקרקע.
במערכת הביטחון נמשכת גם הביקורת על המחדל האבטחתי, ובצה"ל סבורים כי הטיפול בסוגיה צריך להיות תחת אחריות של משרד ממשלתי. גורמים במערכת טוענים כי האירוע היה עלול להסתיים באסון לאומי וליצור שרשרת של פעולות שעלולה הייתה להביא להסלמה אזורית. בתוך כך, מתגבשת במערכת הביטחון תפיסה שלפיה יש להקים בעתיד מסגרת בקהילת המודיעין שתבחן רשימות של טייסים, דיילים ונוסעים המגיעים לישראל.
גם האפשרות למעורבות איראנית עדיין נבדקת. נשיא ארה"ב דונלד טראמפ אמר על ניסיון הפיגוע בטיסת פליי דובאי כי הוא "חושב שאיראן אחראית לכך". מנגד, מוקדם יותר סגנו ג'יי.די. ואנס אמר כי "אין ממצאים חד משמעיים שקושרים את איראן לתקרית", והחקירה ממשיכה לבחון גם את הכיוון הזה.