רבנים בכירים בציונות הדתית יצאו בגלוי נגד קידום חוק יסוד לימוד התורה, על אף תמיכתה הרשמית של המפלגה בחוק. כמה מהם הופיעו בוועדת הכנסת והשמיעו דברים חריפים כנגדו - חלקם מתוך ניסיון אישי כואב.
הרב יעקב מדן, ראש ישיבת הגוש ואביו של פצוע צה"ל אלישע מדן, אמר בוועדה: "תורה שאין בה 'לא תעמוד על דם רעך' - לא תעמוד. תורה שמתעלמת מזה שמשה רבנו עמד בראש צבא ישראל במלחמות הראשונות לכיבוש הארץ, תורה שלא מביטה ביתומים, באלמנות, במשפחות הפצועים - זאת לא התורה שהשם נתן לישראל במעמד הר סיני." מדן הוסיף: "החוק הזה מפלג את העם - איך יכול לבוא ולדבר בשם התורה כשהתורה שלנו כל כך מאחדת?"
הרב תמיר גרנות, ראש ישיבת ההסדר אורות ואב שכול, הציע לשנות את נוסח החוק בשלוש מילים בלבד: "מטרתו של חוק יסוד זה הכרה ולימוד התורה המביא לידי מעשה." לדבריו, אם החוק יעבור במתכונתו הנוכחית, יהפוך לעיקרון המפלג של עם ישראל ולא המאחד.
הרב ירמי סטביסקי, ששכל את חתנו ו-11 בוגרים מתיכון הימלפרב, דיבר על החתן שנהרג כתלמיד חכם שסיים ש"ס בגיל 18: "החוק הזה כל כך קשה למי שהחתן שלו שנהרג היה תלמיד חכם מופלג ואוהב תורה." סטביסקי הוסיף כי מדינת ישראל יכולה לשרוד רק אם החברה החרדית תהיה חלק ממנה.