בעקבות הירי, אמש בבית הכנסת הגדול בקופנהגן, פנה מנכ"ל איגוד הארגונים היהודים באיחוד האירופי, הרב מנחם מרגולין, בקריאה חריפה לראשי המדינות ומוסדות האיחוד האירופי שלדבריו: "קוברים את הראש בחול, ואינם פועלים למניעת התופעה הן במישור הביטחוני והן במישור החינוכי. אנו דורשים ממשלות אירופה ומוסדות האיחוד לתגבר את האבטחה סביב מוסדות יהודיים".
הרב מרגולין המשיך וציין כי: "לצערי ממשלת דנמרק וממשלות נוספות באירופה עדיין לא הפנימו את הצורך לאבטח את כל המוסדות היהודים 24/7. רק בעקבות הפיגוע שקרה מוקדם יותר בבית הקפה, המשטרה שלחה מספר שוטרים לבית הכנסת שהחזירו אש והבריחו את היורה. אך העובדה המצערת היא שאילו לא היה פיגוע בבית הקפה - לא היו שוטרים באזור בית הכנסת, והמאבטח שלא היה חמוש לא היה יכול למנוע לבדו את כניסת המחבל".
הרב מרגולין קרא לראשי הדת המוסלמים באירופה - שרבים מאוד מהם אנשי שלום התומכים באחווה אחווה בין כל הדתות, להשמיע קול רם וברור כנגד ההקצנה נוטפת הדם שנעשית כביכול בשם הדת.
בעקבות הפיגוע ציין הרב מרגולין כי בשבוע הבא יקיים איגוד הארגונים היהודים באיחוד האירופי, סדנה בפראג במהלכה יוכשרו עשרות רבנים וראשי קהילות יהודיות מרחבי היבשת, ההגנה עצמית בסיסית ובהגשת עזרה ראשונה.
"הכתובת הייתה על הקיר כבר מאוגוסט השנה כאשר בית הספר היהודי בעיר נרגם באבנים ורוסס בכתובות אנטישמיות" מציין מנכ"ל איגוד הארגונים היהודים באיחוד האירופי, הרב מרגולין. אנו דורשים ממשלות אירופה, כמו גם המוסדות האיחוד האירופי ליישם את קריאתנו להקמת גוף פן אירופאי להגברת האכיפה סביב מוסדות יהודים ולחינוך כנגד האנטישמיות המשתוללת".