לוחמי חיל הים השתלטו במהלך הלילה (בין רביעי לחמישי) תוך 12 שעות על כ-40 סירות ממשט "סומוד" שעשו את דרכן לרצועת עזה על מנת "לשבור את המצור". מאות הפעילים שעל הסיפון נלקחו לנמל אשדוד, בהם גם הדמות הבולטת ביותר - פעילת האקלים גרטה טונברג. מי מהפעילים שיסכים לכך יגורש מיד חזרה לארצו, ומי שלא - יישפט ויגורש בכוח.
השליטה המבצעית הושגה תוך שעה
בפעילות, שנמשכה כאמור לאורך הלילה, נבלמו עשרות כלי השיט על ידי לוחמי חיל הים ממגוון יחידות - שייטת 13, שייטת ספינות הטילים, לוחמות יחידת סנפיר ועוד. לפני הפעולה, כרזו הלוחמים לאנשים שעל סיפוני הספינות להסתובב חזרה אל הים התיכון, ומשהתנגדו לבקשה - השתלטו על כלי השיט.
תוך שעה הושגה שליטה מבצעית על ששת הכלים הגדולים שהובילו את המשט, כאשר בסיום הפעולה 400 המפליגים הועברו בבטחה אל נמל אשדוד והמשט נבלם. במהלך המבצע החלה לשקוע אחת מספינות המשט בעקבות תקלה טכנית, כאשר פעיליה חולצו מלב ים על ידי הכוח הישראלי.