לפי ההבנה המתגבשת בישראל, מבצע החיסול בקטאר הסתיים בכישלון מוחלט כאשר אף אחד מהצמרת המדינית של חמאס לא חוסל במסגרת התקיפה. בישראל סבורים כי ייתכן ושניים מבכירי חמאס נפצעו, ביניהם ח'ליל אל חיה אך אין לכך אישור סופי. כך לפי דיווח של ערוץ 12.
בין הערכות גורמי הביטחון: בכירי החמאס כלל לא שהו במתחם
לפי הדיווח, במערכת הביטחון נבדקות שתי אפשרויות מרכזיות לכישלון המבצע. לפי אפשרות אחת, הטיל פגע בחלק אחר של המתחם ואילו צמרת מחבלי החמאס שהו בחלק אחר, וכך הצליחו לחמוק מהתקיפה. לפי האפשרות השנייה, אשר נשמעת יותר ויותר במערכת הביטחון, בכירי החמאס כלל לא שנו במתחם אלא רק מאבטחים, דרג זוטר ובני משפחה. בישראל טרם נשלל החשד שבכירי החמאס קיבלו התרעה לפני התקיפה.