במבצע מיוחד וממוקד בהכוונה של אגף המודיעין ובפיקוד אוגדה 36, כוחות צה"ל ושב"כ ובהם כוחות צוות הקרב החטיבתי גולני, לוחמי יחידת יהל"ם ויחידות מיוחדות של אמ"ן, אותרה התשתית התת-קרקעית ובתוכה ממצאים רבים: חדרי פיקוד ושליטה, אמצעי לחימה, וממצאים מודיעיניים נוספים. במהלך הסריקות אותרו מספר גופות מחבלים, זהותן נמצאת בבדיקה.
לאורך המלחמה, צה"ל חשף פעם אחר פעם את השימוש של חמאס בבתי החולים ברחבי רצועת עזה לטובת פעילות טרור והסתתרות של בכירי הזרוע הצבאית של חמאס. התשתית התת-קרקעית אליה הגיע צה"ל נמצאת ממש מתחת לבית החולים האירופאי בחאן יונס וגם היא נבנתה על-ידי חמאס.