לאחרונה החל לשוחח שגריר האיחוד האירופי בישראל - עמנואל ז'ופרה, עם חברי כנסת אשר לוקחים חלק בניסוח החוק, וניסה להניא אותם מהמשך חקיקה. ז'ופרה ביקש מהם לתת את הגעת על הסעיף המורכב, הנמצא בעין הסערה ואשר עוסק במתן אישור ליישובים מופרדי לאום. מי שפעלו למען התערבותו של השגריר הם חברי מפלגת "הרשימה המשותפת".
לדברי השגריר: "החוק מרחיק את ישראל מהנורמות המקובלות במדינות דמוקרטיות. החקיקה נודפת ריח גזעני, מפלה קבוצות, ובמיוחד את ערביי ישראל ופוגעת בערכים שמדינת ישראל מנסה להקרין".
בעקבות כך, זימן ראש הממשלה את השגריר לשיחת נזיפה, ויש להניח כי נתניהו יפעל בדרכים נוספות להבהרת חומרת העניין. לדבריו: "לא די בזה שהאיחוד האירופי מממן עמותות שחותרות נגד מדינת ישראל ומממנות בנייה בלתי חוקית, כעת הוא מתערב בחקיקה ישראלית. כנראה שאינם מבינים שישראל היא מדינה ריבונית".