יותר משבוע לאחר שאביגדור ליברמן התפטר מתפקידו כשר ביטחון, ומספר שעות לפני שהממשלה תאשר את מינויו של אלוף אביב כוכבי לתפקיד הרמטכ"ל, פורסם הבוקר (ראשון) בגלי צה"ל כי נתניהו זעם על ליברמן בעקבות הכרזת האחרון על המינוי
לפי הדיווח, בזמן שיו"ר ישראל ביתנו הכריז על כוכבי כמחליפו של איזנקוט, שהה נתניהו בביקור חשאי בעומאן והתקשר אליו זועם משם.
עוד דווח כי ראש הממשלה, שהעדיף את מינוי של מי שהי מזכירו הצבאי, האלוף אייל זמיר, לתפקיד והוא אף איים על שר הביטחון לשעבר שלא יעלה את אישור המינוי של כוכבי לממשלה. בנוסף, דרש נתניהו כי לצד ההכרזה על כוכבי יוכרז גם זמיר כסגן הרמטכ"ל, אולם ליברמן לא פעל לפי דרישת ראש הממשלה.
מטעמו של ראש הממשלה נמסר בתגובה לפרסום בגלי צה"ל כי "הדיווח מגמתי ורצוף בדיות". בלשכת ליברמן אמרו כי "התמונה שתוארה אינה תואמת את המציאות".