משבר הקורונה מביא להפסקת הפעילות בכלל הסניפים של בני עקיבא. הנהלת התנועה הודיעה כי במקום הפעילות הרגילה, התנועה תייצר אלטרנטיבה לחניכים ותעביר את הפעילות למרחב הוירטואלי, לשם יועתקו פעילויות שונות. 

בנוסף, התנועה תפעל בשטח בעשיה חברתית ככל שיידרש בעקבות המשבר. בין היתר הוקם מוקד מיוחד לסיוע לאנשים הנמצאים בבידוד ובני משפחותיהם בכל בעיה או קושי שעולה וכן פועלת בשטח עם אוכלוסיות הזקוקות לסיוע באופן מיוחד כגון נוער בסיכון, קשישים וכדומה.

מזכ"ל בני עקיבא יאיר שחל: "תנועת בני עקיבא אמנם עצרה לעת עתה את הפעילות בסניפים, אך הפעילות אינה פוסקת ואף מועצמת. התנועה רואה במשבר הנוכחי גם סוג של הזדמנות לחיזוק ערכים נוספים בניהם חיזוק הקשר המשפחתי והחוסן החברתי בחברה הישראלית ותהיה זמינה ומוכנה לפעול ככל שיידרש למען החברה הישראלית".