לאור ההוראות החדשות של משרד הבריאות מפרסם הארגון העולמי של בתי הכנסת בארץ ובעולם הנחיות מעודכנות לבתי הכנסת כהיערכות להתפשטות נגיף הקורונה: 
         
תפילה במניין היא חשובה אך במקום בו לא מתאפשר לעמוד בהוראות משרד הבריאות אין לקיים את התפילה בציבור ויש לבטלה בעת הזו. בבתי כנסת בהם אפשר לקיים את ההוראות יש להקפיד על הכללים הבאים:

1. מספר המתפללים במניין עד עשרה בלבד. אם יש חדרים נוספים/נפרדים אפשר לקיים שם מניין נוסף. במקום שיש עזרת נשים גדולה דיה, יכולים לשהות שם בזמן התפילה עד כ - 10 מתפללים.

2. הקפדה מלאה על מרחק 2 מטרים בין מתפלל לחברו, כולל בזמן קריאת התורה. 
כל זה בנוסף להקפדה על ההנחיות הקודמות: איסור לחיצת ידיים, ניקיון וחיטוי הידיים, שימוש בסידור אישי, איסור על שימוש בטלית ציבורית, מי שבקבוצת סיכון או שאינו חש בטוב לא מגיע לבית הכנסת.

3. למי שאינו מגיע לבית הכנסת ומתפלל בביתו, יש עדיפות הלכתית להתפלל גם ביחיד בזמן שהציבור מתפללים בבית הכנסת.