התקריות ביחידת הקומנדו נחקרות לאחר שבאירוע הראשון, לוחם נפצע במהלך אימון קרב מגע שבוצע ללא ציוד מגן. בתחקיר האירוע נקבע כי האימון היה לא מקצועי ופסול, ובנוסף הועלתה ביקורת על כך שהקצין לא פינה את הלוחם לאחר שנפצע.
באירוע שני ונפרד, נפצע לוחם לאחר שקפץ מרכב מסוג האמר לתוך מערום שיחים. התחקיר העלה שהלוחם קפץ מהרכב בתום אימון. מפקד האוגדה קבע שמדובר "בפעולה פסולה, לא מקצועית, לא ערכית, מסוכנת ושאין בה צורך"
לפי הודעת דובר צה"ל: "לאחר התחקיר הורה המפקד על עצירת האימונים בעוצבה, בדיקה של כלל תיקי התרגילים וביצוע השלמות מקצועיות של התחקיר"